个人鉴定有没有法律效果，对这个问题，如果父亲背着孩子的母亲通过亲子鉴定发现孩子不是自己亲生，仅依此鉴定起诉离婚，是不会得到法院支持的。因为法律规定，诉讼审判中，据以裁判的证据应当同时具备客观性、关联性、合法性三个重要因素因此，如果女方对此予以否认，该鉴定结论是不会被法院所采信的。但也有女方不否认，那法院就会是另外一种态度，也有可能据此判决。基于该鉴定是在没有经过女方同意的情况下做出的，其客观性、合法性等均存在疑问，并且采样过程没有第三方公证系统的见证无法给出法律的责任后果，但个人鉴定是对样本负责的在技术和设备上是一样的结果两样准确。
     而最正确的做法是，男方首先要背着女方做一个亲子鉴定，如孩子是男方的，那就静悄悄地承担结果，对妻子和孩子加倍地好。如发现孩子非亲生也不要着急，在离婚诉讼中向法院提出鉴定亲子关系的申请。如果女方拒绝进行鉴定，根据法律的相关规定，女方应当承担举证不能的法律后果。如果女方不拒绝进行鉴定，那鉴定结果就肯定是你想要要的，因为，任何一家鉴定机构，都会对鉴定结果负责任的。这就是反证法的具体应用，好处就是先提前知道结果，以不破坏现在感情为基础。